摩托车车辆合格证丢失后，您需要采取一系列措施来解决问题：
首先写一份申请书，详细说明合格证丢失的情况。随后，您需要到当地的公安局或派出所进行登报处理。在这一过程中，您需要提供购车时的发票复印件、合格证复印件以及购车人的身份证明复印件。此外，还需填写《合格证补发申请单》，并将其寄回摩托车生产厂家。
生产厂家在收到您的申请并确认无误后，会为您补发新的合格证。拿到新合格证后，您务必仔细核对其中的车架号和发动机号，确保与购车发票信息一致。这样可以避免后续可能出现的问题。
需要特别注意的是，摩托车车辆合格证在上牌后不会返还。这是因为合格证是车辆的“身份证”，是上牌的重要凭证。合格证上最重要的信息是VIN码，它与每辆摩托车一一对应，是车辆独一无二的标识。
因此，摩托车车辆合格证不仅是出厂时的唯一标识，也是新车在车管部门获取牌照的重要凭证。确保合格证的完整性和真实性，对于车辆的后续使用和管理至关重要。
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